Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHBGP04278 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHBGP04278 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHBGP04278 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHBGP04278 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHBGP04278 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHBGP04278 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHBGP04278 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHBGP04278 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHBGP04278 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHBGP04278 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHBGP04278 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHBGP04278 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHBGP04278 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHBGP04278 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHBGP04278 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHBGP04278 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHBGP04278 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHBGP04278 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHBGP04278 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHBGP04278 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHBGP04278 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHBGP04278 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHBGP04278 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHBGP04278 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHBGP04278 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHBGP04278 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHBGP04278 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHBGP04278 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHBGP04278 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHBGP04278 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHBGP04278 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHBGP04278 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHBGP04278 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHBGP04278 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHBGP04278 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHBGP04278 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHBGP04278 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHBGP04278 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHBGP04278 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHBGP04278 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHBGP04278 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHBGP04278 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHBGP04278 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHBGP04278 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHBGP04278 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHBGP04278 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHBGP04278 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHBGP04278 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHBGP04278 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHBGP04278 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHBGP04278 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHBGP04278 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHBGP04278 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHBGP04278 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHBGP04278 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHBGP04278 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHBGP04278 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHBGP04278 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHBGP04278 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHBGP04278 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHBGP04278 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHBGP04278 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHBGP04278 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHBGP04278 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHBGP04278 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHBGP04278 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHBGP04278 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHBGP04278 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHBGP04278 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHBGP04278 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHBGP04278 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHBGP04278 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHBGP04278 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHBGP04278 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHBGP04278 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHBGP04278 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHBGP04278 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHBGP04278 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHBGP04278 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHBGP04278 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHBGP04278 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHBGP04278 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHBGP04278 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHBGP04278 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHBGP04278 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHBGP04278 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHBGP04278 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHBGP04278 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHBGP04278 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHBGP04278 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHBGP04278 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHBGP04278 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHBGP04278 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHBGP04278 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHBGP04278 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHBGP04278 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHBGP04278 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHBGP04278 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHBGP04278 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms