Protein–RNA interactions for Protein: P04179

SOD2, Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD2P04179 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOD2P04179 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOD2P04179 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOD2P04179 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOD2P04179 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOD2P04179 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOD2P04179 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOD2P04179 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOD2P04179 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOD2P04179 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOD2P04179 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOD2P04179 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOD2P04179 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOD2P04179 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOD2P04179 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOD2P04179 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOD2P04179 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOD2P04179 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOD2P04179 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOD2P04179 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SOD2P04179 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOD2P04179 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOD2P04179 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOD2P04179 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOD2P04179 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOD2P04179 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOD2P04179 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOD2P04179 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOD2P04179 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SOD2P04179 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOD2P04179 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOD2P04179 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOD2P04179 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOD2P04179 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SOD2P04179 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOD2P04179 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOD2P04179 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOD2P04179 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOD2P04179 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOD2P04179 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOD2P04179 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOD2P04179 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SOD2P04179 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOD2P04179 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOD2P04179 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOD2P04179 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOD2P04179 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOD2P04179 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOD2P04179 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOD2P04179 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOD2P04179 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SOD2P04179 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SOD2P04179 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOD2P04179 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SOD2P04179 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOD2P04179 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOD2P04179 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOD2P04179 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SOD2P04179 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOD2P04179 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOD2P04179 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOD2P04179 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SOD2P04179 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SOD2P04179 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SOD2P04179 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOD2P04179 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOD2P04179 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOD2P04179 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOD2P04179 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOD2P04179 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOD2P04179 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOD2P04179 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOD2P04179 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOD2P04179 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOD2P04179 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOD2P04179 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOD2P04179 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SOD2P04179 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SOD2P04179 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOD2P04179 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOD2P04179 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOD2P04179 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOD2P04179 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOD2P04179 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOD2P04179 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOD2P04179 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOD2P04179 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOD2P04179 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOD2P04179 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOD2P04179 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOD2P04179 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOD2P04179 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOD2P04179 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOD2P04179 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOD2P04179 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOD2P04179 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOD2P04179 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOD2P04179 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOD2P04179 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOD2P04179 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms