Protein–RNA interactions for Protein: P04114

APOB, Apolipoprotein B-100, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBP04114 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBP04114 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBP04114 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBP04114 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBP04114 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBP04114 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBP04114 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBP04114 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBP04114 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBP04114 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBP04114 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBP04114 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBP04114 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBP04114 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBP04114 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBP04114 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBP04114 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBP04114 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBP04114 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBP04114 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBP04114 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBP04114 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBP04114 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBP04114 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBP04114 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBP04114 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBP04114 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBP04114 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBP04114 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBP04114 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBP04114 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBP04114 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBP04114 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBP04114 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBP04114 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBP04114 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBP04114 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBP04114 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBP04114 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBP04114 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBP04114 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBP04114 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBP04114 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBP04114 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBP04114 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBP04114 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBP04114 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBP04114 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBP04114 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBP04114 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBP04114 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBP04114 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBP04114 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBP04114 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBP04114 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBP04114 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBP04114 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBP04114 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBP04114 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBP04114 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBP04114 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBP04114 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBP04114 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBP04114 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBP04114 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBP04114 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBP04114 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBP04114 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBP04114 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBP04114 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBP04114 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOBP04114 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBP04114 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBP04114 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBP04114 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOBP04114 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBP04114 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBP04114 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBP04114 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBP04114 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBP04114 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBP04114 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBP04114 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBP04114 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBP04114 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBP04114 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBP04114 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBP04114 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBP04114 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBP04114 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBP04114 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBP04114 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBP04114 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBP04114 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBP04114 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBP04114 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBP04114 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBP04114 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBP04114 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBP04114 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms