Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ESR1P03372 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ESR1P03372 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ESR1P03372 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ESR1P03372 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ESR1P03372 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ESR1P03372 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ESR1P03372 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ESR1P03372 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ESR1P03372 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ESR1P03372 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ESR1P03372 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ESR1P03372 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ESR1P03372 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ESR1P03372 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ESR1P03372 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ESR1P03372 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ESR1P03372 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ESR1P03372 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ESR1P03372 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ESR1P03372 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ESR1P03372 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ESR1P03372 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ESR1P03372 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ESR1P03372 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ESR1P03372 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ESR1P03372 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ESR1P03372 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ESR1P03372 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ESR1P03372 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESR1P03372 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESR1P03372 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESR1P03372 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESR1P03372 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESR1P03372 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESR1P03372 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ESR1P03372 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ESR1P03372 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ESR1P03372 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ESR1P03372 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ESR1P03372 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ESR1P03372 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ESR1P03372 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ESR1P03372 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ESR1P03372 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ESR1P03372 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ESR1P03372 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ESR1P03372 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ESR1P03372 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ESR1P03372 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ESR1P03372 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ESR1P03372 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ESR1P03372 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ESR1P03372 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ESR1P03372 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ESR1P03372 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ESR1P03372 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ESR1P03372 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ESR1P03372 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ESR1P03372 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ESR1P03372 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ESR1P03372 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ESR1P03372 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ESR1P03372 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ESR1P03372 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ESR1P03372 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ESR1P03372 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ESR1P03372 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ESR1P03372 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ESR1P03372 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ESR1P03372 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ESR1P03372 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ESR1P03372 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ESR1P03372 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ESR1P03372 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ESR1P03372 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ESR1P03372 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ESR1P03372 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ESR1P03372 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ESR1P03372 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ESR1P03372 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ESR1P03372 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ESR1P03372 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ESR1P03372 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ESR1P03372 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ESR1P03372 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ESR1P03372 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ESR1P03372 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ESR1P03372 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ESR1P03372 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ESR1P03372 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ESR1P03372 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ESR1P03372 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ESR1P03372 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ESR1P03372 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ESR1P03372 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ESR1P03372 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ESR1P03372 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ESR1P03372 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ESR1P03372 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms