Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FGAP02671 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
FGAP02671 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FGAP02671 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FGAP02671 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FGAP02671 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGAP02671 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGAP02671 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FGAP02671 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGAP02671 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGAP02671 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGAP02671 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGAP02671 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGAP02671 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FGAP02671 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGAP02671 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FGAP02671 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FGAP02671 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FGAP02671 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
FGAP02671 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FGAP02671 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FGAP02671 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FGAP02671 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FGAP02671 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FGAP02671 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
FGAP02671 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FGAP02671 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGAP02671 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGAP02671 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FGAP02671 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGAP02671 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FGAP02671 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FGAP02671 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FGAP02671 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FGAP02671 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FGAP02671 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FGAP02671 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FGAP02671 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FGAP02671 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FGAP02671 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FGAP02671 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FGAP02671 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FGAP02671 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FGAP02671 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FGAP02671 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FGAP02671 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FGAP02671 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGAP02671 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FGAP02671 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FGAP02671 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FGAP02671 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FGAP02671 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FGAP02671 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FGAP02671 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FGAP02671 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FGAP02671 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FGAP02671 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FGAP02671 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FGAP02671 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FGAP02671 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FGAP02671 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FGAP02671 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FGAP02671 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FGAP02671 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGAP02671 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGAP02671 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGAP02671 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FGAP02671 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FGAP02671 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FGAP02671 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FGAP02671 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FGAP02671 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FGAP02671 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FGAP02671 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FGAP02671 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FGAP02671 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FGAP02671 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FGAP02671 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FGAP02671 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FGAP02671 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FGAP02671 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FGAP02671 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FGAP02671 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGAP02671 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGAP02671 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGAP02671 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGAP02671 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGAP02671 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGAP02671 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FGAP02671 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGAP02671 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGAP02671 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGAP02671 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGAP02671 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGAP02671 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGAP02671 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGAP02671 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGAP02671 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGAP02671 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGAP02671 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms