Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOC2P02655 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOC2P02655 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOC2P02655 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOC2P02655 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOC2P02655 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOC2P02655 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOC2P02655 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOC2P02655 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APOC2P02655 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOC2P02655 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOC2P02655 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOC2P02655 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOC2P02655 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOC2P02655 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOC2P02655 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOC2P02655 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOC2P02655 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOC2P02655 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOC2P02655 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOC2P02655 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOC2P02655 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOC2P02655 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOC2P02655 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOC2P02655 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOC2P02655 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOC2P02655 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOC2P02655 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOC2P02655 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOC2P02655 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOC2P02655 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOC2P02655 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOC2P02655 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOC2P02655 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOC2P02655 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOC2P02655 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOC2P02655 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOC2P02655 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APOC2P02655 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOC2P02655 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOC2P02655 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOC2P02655 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOC2P02655 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOC2P02655 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOC2P02655 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC2P02655 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC2P02655 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC2P02655 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC2P02655 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC2P02655 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC2P02655 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC2P02655 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC2P02655 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC2P02655 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOC2P02655 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOC2P02655 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOC2P02655 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOC2P02655 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOC2P02655 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOC2P02655 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOC2P02655 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOC2P02655 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOC2P02655 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOC2P02655 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOC2P02655 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOC2P02655 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOC2P02655 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOC2P02655 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOC2P02655 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOC2P02655 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOC2P02655 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOC2P02655 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOC2P02655 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOC2P02655 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOC2P02655 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOC2P02655 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOC2P02655 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOC2P02655 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOC2P02655 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOC2P02655 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOC2P02655 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APOC2P02655 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOC2P02655 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APOC2P02655 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOC2P02655 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOC2P02655 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOC2P02655 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOC2P02655 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APOC2P02655 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOC2P02655 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOC2P02655 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC2P02655 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC2P02655 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC2P02655 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC2P02655 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC2P02655 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC2P02655 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC2P02655 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC2P02655 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC2P02655 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms