Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC1P02654 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC1P02654 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC1P02654 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC1P02654 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC1P02654 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC1P02654 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC1P02654 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC1P02654 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC1P02654 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC1P02654 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC1P02654 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC1P02654 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC1P02654 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC1P02654 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC1P02654 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC1P02654 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC1P02654 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC1P02654 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC1P02654 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC1P02654 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC1P02654 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
APOC1P02654 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOC1P02654 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOC1P02654 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC1P02654 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC1P02654 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC1P02654 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOC1P02654 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOC1P02654 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOC1P02654 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC1P02654 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOC1P02654 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOC1P02654 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOC1P02654 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOC1P02654 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOC1P02654 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
APOC1P02654 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APOC1P02654 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOC1P02654 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOC1P02654 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOC1P02654 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOC1P02654 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOC1P02654 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOC1P02654 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOC1P02654 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOC1P02654 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
APOC1P02654 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOC1P02654 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOC1P02654 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOC1P02654 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOC1P02654 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOC1P02654 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOC1P02654 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOC1P02654 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC1P02654 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOC1P02654 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC1P02654 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
APOC1P02654 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC1P02654 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC1P02654 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC1P02654 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC1P02654 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOC1P02654 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOC1P02654 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOC1P02654 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC1P02654 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC1P02654 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC1P02654 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC1P02654 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC1P02654 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC1P02654 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC1P02654 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC1P02654 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC1P02654 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC1P02654 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC1P02654 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC1P02654 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC1P02654 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC1P02654 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC1P02654 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC1P02654 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC1P02654 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC1P02654 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC1P02654 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC1P02654 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC1P02654 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC1P02654 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC1P02654 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC1P02654 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC1P02654 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC1P02654 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC1P02654 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC1P02654 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC1P02654 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC1P02654 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC1P02654 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC1P02654 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC1P02654 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC1P02654 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms