Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV3-9P01782 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-9P01782 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-9P01782 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms