Protein–RNA interactions for Protein: P01350

GAST, Gastrin, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GASTP01350 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GASTP01350 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GASTP01350 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GASTP01350 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GASTP01350 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GASTP01350 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GASTP01350 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GASTP01350 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GASTP01350 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GASTP01350 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GASTP01350 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GASTP01350 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GASTP01350 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GASTP01350 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GASTP01350 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GASTP01350 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GASTP01350 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GASTP01350 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GASTP01350 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GASTP01350 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GASTP01350 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GASTP01350 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GASTP01350 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GASTP01350 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GASTP01350 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GASTP01350 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GASTP01350 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GASTP01350 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GASTP01350 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GASTP01350 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GASTP01350 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GASTP01350 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GASTP01350 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GASTP01350 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GASTP01350 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GASTP01350 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GASTP01350 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GASTP01350 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GASTP01350 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GASTP01350 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GASTP01350 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GASTP01350 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GASTP01350 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GASTP01350 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GASTP01350 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GASTP01350 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GASTP01350 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GASTP01350 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GASTP01350 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GASTP01350 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GASTP01350 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GASTP01350 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GASTP01350 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GASTP01350 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GASTP01350 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GASTP01350 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GASTP01350 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GASTP01350 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GASTP01350 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GASTP01350 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GASTP01350 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GASTP01350 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GASTP01350 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GASTP01350 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GASTP01350 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GASTP01350 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GASTP01350 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GASTP01350 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GASTP01350 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GASTP01350 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GASTP01350 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GASTP01350 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GASTP01350 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GASTP01350 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GASTP01350 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GASTP01350 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GASTP01350 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GASTP01350 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GASTP01350 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GASTP01350 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GASTP01350 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GASTP01350 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GASTP01350 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GASTP01350 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GASTP01350 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GASTP01350 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GASTP01350 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GASTP01350 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GASTP01350 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GASTP01350 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GASTP01350 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GASTP01350 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GASTP01350 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GASTP01350 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GASTP01350 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GASTP01350 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GASTP01350 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GASTP01350 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GASTP01350 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GASTP01350 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms