Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGFB1P01137 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFB1P01137 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGFB1P01137 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms