Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX11BO96011 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX11BO96011 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PEX11BO96011 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX11BO96011 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms