Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDX58O95786 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDX58O95786 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
DDX58O95786 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
DDX58O95786 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DDX58O95786 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DDX58O95786 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DDX58O95786 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DDX58O95786 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DDX58O95786 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DDX58O95786 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DDX58O95786 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DDX58O95786 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDX58O95786 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDX58O95786 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDX58O95786 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDX58O95786 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDX58O95786 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDX58O95786 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
DDX58O95786 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDX58O95786 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDX58O95786 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDX58O95786 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
DDX58O95786 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DDX58O95786 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DDX58O95786 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DDX58O95786 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
DDX58O95786 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DDX58O95786 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DDX58O95786 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DDX58O95786 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DDX58O95786 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDX58O95786 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDX58O95786 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDX58O95786 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDX58O95786 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDX58O95786 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDX58O95786 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDX58O95786 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDX58O95786 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDX58O95786 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDX58O95786 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDX58O95786 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DDX58O95786 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DDX58O95786 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DDX58O95786 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDX58O95786 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDX58O95786 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDX58O95786 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDX58O95786 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDX58O95786 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDX58O95786 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDX58O95786 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDX58O95786 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDX58O95786 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDX58O95786 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDX58O95786 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDX58O95786 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDX58O95786 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDX58O95786 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDX58O95786 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDX58O95786 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDX58O95786 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDX58O95786 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDX58O95786 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDX58O95786 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDX58O95786 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDX58O95786 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDX58O95786 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DDX58O95786 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DDX58O95786 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DDX58O95786 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DDX58O95786 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DDX58O95786 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDX58O95786 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDX58O95786 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDX58O95786 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDX58O95786 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDX58O95786 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
DDX58O95786 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
DDX58O95786 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DDX58O95786 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDX58O95786 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDX58O95786 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDX58O95786 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
DDX58O95786 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDX58O95786 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDX58O95786 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDX58O95786 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DDX58O95786 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DDX58O95786 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DDX58O95786 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDX58O95786 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDX58O95786 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDX58O95786 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDX58O95786 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDX58O95786 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDX58O95786 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDX58O95786 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
DDX58O95786 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms