Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CPNE6O95741 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE6O95741 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms