Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAMBPO95630 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STAMBPO95630 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STAMBPO95630 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms