Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CAMTA2O94983 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CAMTA2O94983 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CAMTA2O94983 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CAMTA2O94983 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CAMTA2O94983 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CAMTA2O94983 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAMTA2O94983 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAMTA2O94983 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAMTA2O94983 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAMTA2O94983 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CAMTA2O94983 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAMTA2O94983 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CAMTA2O94983 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CAMTA2O94983 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CAMTA2O94983 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CAMTA2O94983 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms