Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
SOGA1O94964 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
SOGA1O94964 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SOGA1O94964 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SOGA1O94964 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SOGA1O94964 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SOGA1O94964 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SOGA1O94964 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SOGA1O94964 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
SOGA1O94964 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SOGA1O94964 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
SOGA1O94964 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
SOGA1O94964 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
SOGA1O94964 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
SOGA1O94964 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
SOGA1O94964 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC41.61■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
SOGA1O94964 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
SOGA1O94964 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SOGA1O94964 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
SOGA1O94964 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
SOGA1O94964 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SOGA1O94964 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SOGA1O94964 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SOGA1O94964 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SOGA1O94964 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SOGA1O94964 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
SOGA1O94964 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
SOGA1O94964 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
SOGA1O94964 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
SOGA1O94964 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.5■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.5■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms