Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRPA1O75762 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRPA1O75762 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TRPA1O75762 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPA1O75762 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPA1O75762 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPA1O75762 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRPA1O75762 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPA1O75762 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPA1O75762 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRPA1O75762 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPA1O75762 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRPA1O75762 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPA1O75762 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPA1O75762 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPA1O75762 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRPA1O75762 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRPA1O75762 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRPA1O75762 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms