Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB3O75712 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GJB3O75712 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB3O75712 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB3O75712 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB3O75712 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB3O75712 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GJB3O75712 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB3O75712 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB3O75712 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB3O75712 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB3O75712 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB3O75712 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB3O75712 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB3O75712 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB3O75712 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB3O75712 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB3O75712 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB3O75712 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJB3O75712 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB3O75712 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB3O75712 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB3O75712 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB3O75712 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB3O75712 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB3O75712 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB3O75712 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB3O75712 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB3O75712 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB3O75712 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB3O75712 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB3O75712 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB3O75712 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB3O75712 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB3O75712 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB3O75712 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB3O75712 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB3O75712 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB3O75712 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB3O75712 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB3O75712 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB3O75712 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB3O75712 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB3O75712 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB3O75712 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB3O75712 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB3O75712 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB3O75712 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB3O75712 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB3O75712 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB3O75712 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB3O75712 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB3O75712 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB3O75712 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB3O75712 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB3O75712 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB3O75712 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB3O75712 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB3O75712 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJB3O75712 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJB3O75712 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB3O75712 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB3O75712 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB3O75712 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB3O75712 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB3O75712 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB3O75712 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB3O75712 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB3O75712 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB3O75712 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB3O75712 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB3O75712 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB3O75712 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB3O75712 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB3O75712 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB3O75712 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB3O75712 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB3O75712 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB3O75712 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB3O75712 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB3O75712 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB3O75712 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB3O75712 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB3O75712 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB3O75712 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB3O75712 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB3O75712 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB3O75712 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB3O75712 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB3O75712 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB3O75712 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB3O75712 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB3O75712 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB3O75712 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB3O75712 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB3O75712 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB3O75712 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB3O75712 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB3O75712 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB3O75712 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms