Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSDE1O75534 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CSDE1O75534 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSDE1O75534 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CSDE1O75534 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms