Protein–RNA interactions for Protein: O75509

TNFRSF21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF21O75509 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF21O75509 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF21O75509 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF21O75509 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms