Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F6O75461 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F6O75461 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E2F6O75461 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F6O75461 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F6O75461 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F6O75461 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F6O75461 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E2F6O75461 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F6O75461 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F6O75461 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F6O75461 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F6O75461 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F6O75461 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E2F6O75461 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F6O75461 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F6O75461 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F6O75461 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F6O75461 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F6O75461 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E2F6O75461 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F6O75461 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F6O75461 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F6O75461 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F6O75461 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F6O75461 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F6O75461 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F6O75461 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F6O75461 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F6O75461 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F6O75461 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F6O75461 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F6O75461 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E2F6O75461 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F6O75461 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E2F6O75461 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F6O75461 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F6O75461 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F6O75461 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F6O75461 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
E2F6O75461 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F6O75461 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F6O75461 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F6O75461 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F6O75461 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F6O75461 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F6O75461 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E2F6O75461 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F6O75461 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F6O75461 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F6O75461 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F6O75461 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F6O75461 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F6O75461 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F6O75461 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E2F6O75461 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F6O75461 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F6O75461 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F6O75461 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F6O75461 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F6O75461 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E2F6O75461 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F6O75461 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F6O75461 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F6O75461 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F6O75461 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F6O75461 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F6O75461 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F6O75461 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F6O75461 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E2F6O75461 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F6O75461 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F6O75461 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F6O75461 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F6O75461 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F6O75461 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F6O75461 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E2F6O75461 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F6O75461 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F6O75461 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F6O75461 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E2F6O75461 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2F6O75461 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E2F6O75461 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F6O75461 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F6O75461 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F6O75461 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F6O75461 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F6O75461 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E2F6O75461 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F6O75461 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F6O75461 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F6O75461 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F6O75461 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F6O75461 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F6O75461 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F6O75461 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F6O75461 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F6O75461 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F6O75461 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms