Protein–RNA interactions for Protein: O75368

SH3BGRL, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRLO75368 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BGRLO75368 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRLO75368 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms