Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPSNAP2O75323 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NIPSNAP2O75323 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NIPSNAP2O75323 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms