Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SS18L1O75177 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SS18L1O75177 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SS18L1O75177 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SS18L1O75177 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms