Protein–RNA interactions for Protein: O60882

MMP20, Matrix metalloproteinase-20, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP20O60882 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP20O60882 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP20O60882 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP20O60882 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP20O60882 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP20O60882 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP20O60882 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP20O60882 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP20O60882 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP20O60882 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP20O60882 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP20O60882 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP20O60882 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP20O60882 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP20O60882 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP20O60882 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP20O60882 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP20O60882 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP20O60882 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP20O60882 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MMP20O60882 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP20O60882 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP20O60882 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP20O60882 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP20O60882 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP20O60882 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MMP20O60882 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP20O60882 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP20O60882 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MMP20O60882 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP20O60882 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP20O60882 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP20O60882 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP20O60882 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP20O60882 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP20O60882 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP20O60882 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP20O60882 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP20O60882 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP20O60882 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP20O60882 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP20O60882 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MMP20O60882 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MMP20O60882 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP20O60882 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP20O60882 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP20O60882 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP20O60882 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP20O60882 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP20O60882 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP20O60882 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP20O60882 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP20O60882 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP20O60882 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP20O60882 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP20O60882 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP20O60882 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP20O60882 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP20O60882 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP20O60882 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP20O60882 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP20O60882 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP20O60882 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP20O60882 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP20O60882 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP20O60882 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP20O60882 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP20O60882 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP20O60882 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP20O60882 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP20O60882 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP20O60882 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP20O60882 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP20O60882 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP20O60882 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP20O60882 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP20O60882 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP20O60882 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP20O60882 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP20O60882 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP20O60882 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP20O60882 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP20O60882 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP20O60882 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP20O60882 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP20O60882 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP20O60882 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP20O60882 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP20O60882 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP20O60882 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP20O60882 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP20O60882 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP20O60882 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP20O60882 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP20O60882 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP20O60882 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP20O60882 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP20O60882 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP20O60882 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP20O60882 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms