Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM17BO60830 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TIMM17BO60830 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM17BO60830 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM17BO60830 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM17BO60830 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM17BO60830 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM17BO60830 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM17BO60830 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMM17BO60830 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM17BO60830 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM17BO60830 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM17BO60830 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM17BO60830 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM17BO60830 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM17BO60830 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMM17BO60830 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM17BO60830 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM17BO60830 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms