Protein–RNA interactions for Protein: O60779

SLC19A2, Thiamine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A2O60779 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC19A2O60779 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC19A2O60779 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC19A2O60779 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms