Protein–RNA interactions for Protein: O60568

PLOD3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD3O60568 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PLOD3O60568 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLOD3O60568 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLOD3O60568 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms