Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACSL4O60488 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACSL4O60488 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACSL4O60488 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACSL4O60488 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACSL4O60488 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL4O60488 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSL4O60488 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL4O60488 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms