Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NME2P1O60361 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NME2P1O60361 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NME2P1O60361 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms