Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUPR1O60356 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUPR1O60356 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUPR1O60356 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms