Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC28A2O43868 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC28A2O43868 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC28A2O43868 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms