Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3O43617 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3O43617 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC3O43617 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3O43617 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms