Protein–RNA interactions for Protein: O43561

LAT, Linker for activation of T-cells family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATO43561 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LATO43561 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LATO43561 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LATO43561 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LATO43561 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LATO43561 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LATO43561 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LATO43561 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LATO43561 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LATO43561 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LATO43561 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LATO43561 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LATO43561 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LATO43561 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LATO43561 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LATO43561 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LATO43561 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LATO43561 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LATO43561 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LATO43561 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LATO43561 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LATO43561 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LATO43561 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LATO43561 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LATO43561 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LATO43561 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LATO43561 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LATO43561 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LATO43561 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LATO43561 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LATO43561 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LATO43561 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LATO43561 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LATO43561 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LATO43561 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LATO43561 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LATO43561 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LATO43561 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LATO43561 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LATO43561 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LATO43561 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LATO43561 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LATO43561 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LATO43561 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LATO43561 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LATO43561 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LATO43561 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LATO43561 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LATO43561 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LATO43561 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LATO43561 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LATO43561 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LATO43561 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LATO43561 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LATO43561 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LATO43561 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LATO43561 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LATO43561 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LATO43561 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LATO43561 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LATO43561 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LATO43561 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LATO43561 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LATO43561 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LATO43561 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LATO43561 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LATO43561 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LATO43561 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LATO43561 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LATO43561 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LATO43561 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LATO43561 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LATO43561 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LATO43561 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LATO43561 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LATO43561 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LATO43561 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LATO43561 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LATO43561 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LATO43561 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LATO43561 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LATO43561 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LATO43561 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LATO43561 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LATO43561 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LATO43561 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LATO43561 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LATO43561 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LATO43561 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LATO43561 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LATO43561 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LATO43561 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LATO43561 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LATO43561 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LATO43561 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LATO43561 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LATO43561 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LATO43561 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LATO43561 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LATO43561 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms