Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TBX1O43435 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBX1O43435 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBX1O43435 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBX1O43435 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBX1O43435 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBX1O43435 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBX1O43435 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBX1O43435 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBX1O43435 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TBX1O43435 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TBX1O43435 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TBX1O43435 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TBX1O43435 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TBX1O43435 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TBX1O43435 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TBX1O43435 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBX1O43435 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBX1O43435 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBX1O43435 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBX1O43435 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBX1O43435 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBX1O43435 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBX1O43435 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBX1O43435 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TBX1O43435 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBX1O43435 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBX1O43435 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBX1O43435 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBX1O43435 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBX1O43435 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBX1O43435 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBX1O43435 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TBX1O43435 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBX1O43435 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBX1O43435 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBX1O43435 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBX1O43435 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBX1O43435 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBX1O43435 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBX1O43435 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBX1O43435 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBX1O43435 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBX1O43435 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBX1O43435 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBX1O43435 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBX1O43435 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBX1O43435 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBX1O43435 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TBX1O43435 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBX1O43435 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBX1O43435 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBX1O43435 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBX1O43435 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBX1O43435 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBX1O43435 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBX1O43435 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBX1O43435 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBX1O43435 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBX1O43435 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBX1O43435 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBX1O43435 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBX1O43435 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBX1O43435 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBX1O43435 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBX1O43435 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBX1O43435 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TBX1O43435 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBX1O43435 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBX1O43435 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBX1O43435 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBX1O43435 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBX1O43435 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX1O43435 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX1O43435 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX1O43435 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX1O43435 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX1O43435 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX1O43435 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBX1O43435 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBX1O43435 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBX1O43435 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX1O43435 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX1O43435 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX1O43435 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX1O43435 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX1O43435 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX1O43435 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBX1O43435 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBX1O43435 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBX1O43435 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBX1O43435 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBX1O43435 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBX1O43435 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBX1O43435 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBX1O43435 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBX1O43435 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBX1O43435 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBX1O43435 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBX1O43435 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms