Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTSS1O43312 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTSS1O43312 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTSS1O43312 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTSS1O43312 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTSS1O43312 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTSS1O43312 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTSS1O43312 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTSS1O43312 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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