Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SRGAP3O43295 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SRGAP3O43295 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SRGAP3O43295 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SRGAP3O43295 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SRGAP3O43295 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SRGAP3O43295 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SRGAP3O43295 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SRGAP3O43295 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SRGAP3O43295 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SRGAP3O43295 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SRGAP3O43295 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SRGAP3O43295 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SRGAP3O43295 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SRGAP3O43295 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SRGAP3O43295 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SRGAP3O43295 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms