Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUPL2O15504 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NUPL2O15504 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms