Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNPHO15079 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNPHO15079 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNPHO15079 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNPHO15079 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNPHO15079 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNPHO15079 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNPHO15079 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNPHO15079 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNPHO15079 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNPHO15079 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNPHO15079 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNPHO15079 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNPHO15079 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNPHO15079 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNPHO15079 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNPHO15079 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNPHO15079 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNPHO15079 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNPHO15079 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNPHO15079 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNPHO15079 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNPHO15079 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNPHO15079 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNPHO15079 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNPHO15079 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNPHO15079 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNPHO15079 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNPHO15079 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNPHO15079 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNPHO15079 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNPHO15079 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNPHO15079 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNPHO15079 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNPHO15079 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNPHO15079 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNPHO15079 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNPHO15079 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNPHO15079 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNPHO15079 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNPHO15079 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNPHO15079 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNPHO15079 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNPHO15079 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNPHO15079 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNPHO15079 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNPHO15079 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNPHO15079 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNPHO15079 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNPHO15079 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNPHO15079 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNPHO15079 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNPHO15079 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNPHO15079 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNPHO15079 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNPHO15079 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNPHO15079 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNPHO15079 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNPHO15079 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNPHO15079 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNPHO15079 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNPHO15079 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNPHO15079 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNPHO15079 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNPHO15079 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNPHO15079 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNPHO15079 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNPHO15079 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNPHO15079 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNPHO15079 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNPHO15079 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNPHO15079 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNPHO15079 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNPHO15079 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNPHO15079 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNPHO15079 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNPHO15079 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNPHO15079 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNPHO15079 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNPHO15079 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNPHO15079 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNPHO15079 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNPHO15079 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNPHO15079 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNPHO15079 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNPHO15079 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNPHO15079 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNPHO15079 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNPHO15079 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNPHO15079 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNPHO15079 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNPHO15079 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNPHO15079 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNPHO15079 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNPHO15079 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNPHO15079 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNPHO15079 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNPHO15079 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNPHO15079 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNPHO15079 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms