Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
CUX2O14529 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
CUX2O14529 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
CUX2O14529 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
CUX2O14529 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CUX2O14529 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CUX2O14529 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CUX2O14529 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CUX2O14529 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CUX2O14529 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CUX2O14529 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CUX2O14529 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
CUX2O14529 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
CUX2O14529 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CUX2O14529 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
CUX2O14529 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
CUX2O14529 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
CUX2O14529 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
CUX2O14529 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
CUX2O14529 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CUX2O14529 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CUX2O14529 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CUX2O14529 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CUX2O14529 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
CUX2O14529 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CUX2O14529 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CUX2O14529 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CUX2O14529 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CUX2O14529 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CUX2O14529 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CUX2O14529 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CUX2O14529 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CUX2O14529 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CUX2O14529 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.43
CUX2O14529 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CUX2O14529 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CUX2O14529 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CUX2O14529 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CUX2O14529 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CUX2O14529 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CUX2O14529 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
CUX2O14529 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
CUX2O14529 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CUX2O14529 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
CUX2O14529 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
CUX2O14529 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
CUX2O14529 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
CUX2O14529 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
CUX2O14529 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
CUX2O14529 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
CUX2O14529 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
CUX2O14529 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
CUX2O14529 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.43
CUX2O14529 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CUX2O14529 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CUX2O14529 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
CUX2O14529 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CUX2O14529 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CUX2O14529 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CUX2O14529 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CUX2O14529 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CUX2O14529 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
CUX2O14529 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
CUX2O14529 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CUX2O14529 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CUX2O14529 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CUX2O14529 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CUX2O14529 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
CUX2O14529 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CUX2O14529 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
CUX2O14529 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CUX2O14529 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CUX2O14529 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CUX2O14529 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CUX2O14529 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CUX2O14529 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CUX2O14529 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CUX2O14529 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.42
CUX2O14529 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC42.63■■■■■ 4.42
CUX2O14529 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.42
CUX2O14529 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CUX2O14529 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CUX2O14529 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CUX2O14529 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CUX2O14529 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CUX2O14529 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CUX2O14529 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CUX2O14529 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
CUX2O14529 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
CUX2O14529 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CUX2O14529 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CUX2O14529 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
CUX2O14529 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
CUX2O14529 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
CUX2O14529 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CUX2O14529 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CUX2O14529 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CUX2O14529 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
CUX2O14529 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
CUX2O14529 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms