Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP9YO00507 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP9YO00507 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP9YO00507 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP9YO00507 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP9YO00507 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP9YO00507 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP9YO00507 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP9YO00507 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP9YO00507 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP9YO00507 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP9YO00507 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP9YO00507 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP9YO00507 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP9YO00507 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP9YO00507 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP9YO00507 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP9YO00507 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP9YO00507 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP9YO00507 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP9YO00507 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP9YO00507 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP9YO00507 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP9YO00507 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP9YO00507 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP9YO00507 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP9YO00507 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP9YO00507 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP9YO00507 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP9YO00507 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP9YO00507 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP9YO00507 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP9YO00507 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP9YO00507 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP9YO00507 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP9YO00507 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP9YO00507 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP9YO00507 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP9YO00507 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP9YO00507 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9YO00507 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9YO00507 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9YO00507 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9YO00507 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9YO00507 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9YO00507 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9YO00507 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9YO00507 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9YO00507 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP9YO00507 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP9YO00507 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP9YO00507 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP9YO00507 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP9YO00507 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP9YO00507 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP9YO00507 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP9YO00507 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP9YO00507 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP9YO00507 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP9YO00507 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP9YO00507 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP9YO00507 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP9YO00507 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP9YO00507 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP9YO00507 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP9YO00507 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP9YO00507 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP9YO00507 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP9YO00507 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP9YO00507 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP9YO00507 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP9YO00507 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP9YO00507 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP9YO00507 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP9YO00507 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP9YO00507 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP9YO00507 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP9YO00507 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP9YO00507 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP9YO00507 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP9YO00507 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP9YO00507 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP9YO00507 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP9YO00507 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP9YO00507 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP9YO00507 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP9YO00507 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP9YO00507 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP9YO00507 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP9YO00507 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP9YO00507 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP9YO00507 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP9YO00507 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP9YO00507 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP9YO00507 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP9YO00507 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP9YO00507 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP9YO00507 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP9YO00507 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP9YO00507 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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