Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLOD2O00469 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLOD2O00469 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLOD2O00469 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms