Protein–RNA interactions for Protein: O00255

MEN1, Menin, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1O00255 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEN1O00255 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEN1O00255 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MEN1O00255 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEN1O00255 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEN1O00255 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEN1O00255 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEN1O00255 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MEN1O00255 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MEN1O00255 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEN1O00255 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEN1O00255 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEN1O00255 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEN1O00255 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEN1O00255 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEN1O00255 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEN1O00255 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEN1O00255 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEN1O00255 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MEN1O00255 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEN1O00255 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEN1O00255 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEN1O00255 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEN1O00255 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEN1O00255 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEN1O00255 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEN1O00255 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEN1O00255 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEN1O00255 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEN1O00255 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MEN1O00255 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEN1O00255 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEN1O00255 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEN1O00255 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEN1O00255 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEN1O00255 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEN1O00255 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEN1O00255 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEN1O00255 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEN1O00255 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEN1O00255 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEN1O00255 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MEN1O00255 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEN1O00255 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEN1O00255 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEN1O00255 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEN1O00255 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEN1O00255 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEN1O00255 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEN1O00255 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEN1O00255 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEN1O00255 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MEN1O00255 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEN1O00255 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEN1O00255 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEN1O00255 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEN1O00255 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEN1O00255 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEN1O00255 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEN1O00255 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MEN1O00255 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEN1O00255 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEN1O00255 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEN1O00255 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEN1O00255 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEN1O00255 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEN1O00255 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEN1O00255 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEN1O00255 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEN1O00255 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEN1O00255 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEN1O00255 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEN1O00255 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEN1O00255 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEN1O00255 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEN1O00255 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEN1O00255 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEN1O00255 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEN1O00255 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEN1O00255 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEN1O00255 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEN1O00255 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEN1O00255 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEN1O00255 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEN1O00255 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEN1O00255 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEN1O00255 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MEN1O00255 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEN1O00255 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEN1O00255 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEN1O00255 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEN1O00255 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEN1O00255 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEN1O00255 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEN1O00255 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEN1O00255 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEN1O00255 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEN1O00255 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEN1O00255 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEN1O00255 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms