Protein–RNA interactions for Protein: O00206

TLR4, Toll-like receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR4O00206 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR4O00206 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR4O00206 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR4O00206 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR4O00206 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR4O00206 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR4O00206 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR4O00206 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR4O00206 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR4O00206 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR4O00206 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR4O00206 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR4O00206 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR4O00206 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR4O00206 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR4O00206 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR4O00206 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR4O00206 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR4O00206 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR4O00206 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR4O00206 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR4O00206 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR4O00206 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR4O00206 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR4O00206 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR4O00206 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR4O00206 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR4O00206 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR4O00206 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR4O00206 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR4O00206 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR4O00206 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR4O00206 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR4O00206 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR4O00206 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR4O00206 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR4O00206 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR4O00206 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR4O00206 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR4O00206 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR4O00206 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR4O00206 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR4O00206 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR4O00206 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR4O00206 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR4O00206 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR4O00206 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR4O00206 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR4O00206 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR4O00206 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR4O00206 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR4O00206 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR4O00206 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR4O00206 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR4O00206 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR4O00206 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR4O00206 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR4O00206 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR4O00206 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR4O00206 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR4O00206 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR4O00206 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR4O00206 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR4O00206 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR4O00206 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR4O00206 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR4O00206 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR4O00206 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR4O00206 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR4O00206 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR4O00206 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR4O00206 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR4O00206 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR4O00206 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR4O00206 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR4O00206 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR4O00206 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR4O00206 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR4O00206 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR4O00206 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR4O00206 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR4O00206 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLR4O00206 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR4O00206 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR4O00206 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR4O00206 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR4O00206 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLR4O00206 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR4O00206 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR4O00206 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLR4O00206 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TLR4O00206 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TLR4O00206 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR4O00206 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR4O00206 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR4O00206 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR4O00206 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR4O00206 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR4O00206 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR4O00206 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms