Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX39AO00148 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX39AO00148 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX39AO00148 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX39AO00148 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DDX39AO00148 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX39AO00148 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX39AO00148 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX39AO00148 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX39AO00148 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DDX39AO00148 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX39AO00148 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX39AO00148 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX39AO00148 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms