Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms