Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2K7ER74 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2K7ER74 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2K7ER74 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms