Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMIM22K7EJ46 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMIM22K7EJ46 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMIM22K7EJ46 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMIM22K7EJ46 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms