Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC01387J3KSC0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINC01387J3KSC0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms