Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
I3L4J1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
I3L4J1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
I3L4J1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
I3L4J1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
I3L4J1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
I3L4J1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
I3L4J1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
I3L4J1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
I3L4J1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
I3L4J1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
I3L4J1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
I3L4J1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
I3L4J1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
I3L4J1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
I3L4J1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
I3L4J1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
I3L4J1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
I3L4J1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
I3L4J1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
I3L4J1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
I3L4J1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
I3L4J1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
I3L4J1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
I3L4J1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
I3L4J1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
I3L4J1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
I3L4J1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
I3L4J1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
I3L4J1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
I3L4J1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
I3L4J1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
I3L4J1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
I3L4J1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
I3L4J1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
I3L4J1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
I3L4J1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
I3L4J1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
I3L4J1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
I3L4J1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
I3L4J1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
I3L4J1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
I3L4J1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
I3L4J1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
I3L4J1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
I3L4J1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
I3L4J1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
I3L4J1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
I3L4J1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
I3L4J1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
I3L4J1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
I3L4J1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
I3L4J1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
I3L4J1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
I3L4J1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
I3L4J1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
I3L4J1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
I3L4J1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
I3L4J1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
I3L4J1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
I3L4J1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
I3L4J1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
I3L4J1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
I3L4J1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
I3L4J1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
I3L4J1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
I3L4J1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
I3L4J1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
I3L4J1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
I3L4J1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
I3L4J1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
I3L4J1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
I3L4J1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
I3L4J1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
I3L4J1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
I3L4J1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
I3L4J1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
I3L4J1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
I3L4J1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
I3L4J1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
I3L4J1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
I3L4J1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
I3L4J1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
I3L4J1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
I3L4J1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
I3L4J1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
I3L4J1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
I3L4J1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
I3L4J1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
I3L4J1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
I3L4J1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
I3L4J1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
I3L4J1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
I3L4J1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
I3L4J1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
I3L4J1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
I3L4J1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
I3L4J1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
I3L4J1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
I3L4J1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms